La différence c’est que :
Les négationnistes nient des faits mille fois prouvés et avérés : nier ces faits est induire les autres en erreur.
Une religion est une opinion elle est donc discutable et contestable (vision agnostique).
Une religion est un mythe jamais prouvé : la professer est induire les autres en erreur et devrait être condamné aussi durement que le négationnisme (vision athée).